Skip to main content

Advertisement

Table 3 Oxidative stress related genes that show a significant change with microarray analysis after mutant huntingtin expression

From: Mutant huntingtin activates Nrf2-responsive genes and impairs dopamine synthesis in a PC12 model of Huntington's disease

Nrf2 responsive genes
Gene name Accession# Ratio day 0 Ratio day 1 Ratio day 5 P value day 0 P value day 1 P value day 5  
Detoxification
Nqo1 NM_017000 0,153161338 0,09509419 0,9313329 0,833712475 0,927082425 0,000223519
Gsta4 XM_217195 -0,275666227 -0,314801025 0,413131618 0,253015701 0,120614239 0,006374434
Gstp2 NM_138974 0,382499361 0,418277366 1,459294326 0,30465786 0,189513652 2,28E-07
Antioxidant/reducing Potential
Gclc NM_012815 0,050889982 0,064489288 0,553224444 0,935159305 0,921933889 0,000668569
Txnrd1 NM_031614 0,043006071 0,068186563 0,416963683 0,920763898 0,85987218 0,000404461
Prdx6 NM_053576 -0,529339334 -0,578113241 -0,680873497 0,084587704 0,038158555 0,003140611
Taldo1 NM_031811 0,009418008 0,032634451 -0,237774271 0,986167462 0,947870016 0,026954523
Me1 NM_012600 -0,000528861 0,013155505 0,269261838 0,998825398 0,98787689 0,021535996
Gene name Accession# Ratio day 0 Ratio day 1 Ratio day 5 P value day 0 P value day 1 P value day 5  
TGF beta signalling pathway
Bambi NM_139082 -0,039617538 -0,026338592 -0,864880442 0,977785277 0,990188964 0,00336128
Smad4 NM_019275 -0,203348936 -0,40795009 -0,373068895 0,356782837 0,006017924 0,003289649
Map3k1 NM_053887 -0,299368715 -0,358856734 -0,690663403 0,55056724 0,382654757 0,004166232
Tgfb1 NM_021578 -0,126020083 -0,168731098 -0,366913617 0,684930689 0,490885028 0,004166232
Madh7 (smad7) NM_030858 -0,264074403 -0,230874139 -0,588447764 0,720614387 0,784042896 0,049193592
Oxidative stress
Epas1 NM_023090 -0,270174359 -0,478814403 -1,093139357 0,688153639 0,259648489 0,000173015
Frd1 XM_574642 0,131200174 0,166324378 0,387371459 0,560092481 0,355116774 0,000497262
Mt3 NM_053968 0,415104171 0,340566391 1,552629091 0,456685437 0,588382185 4,64E-06
Gpx1 NM_030826 0,118639332 0,007736138 0,307368335 0,5834878 0,991968688 0,002399689
Electron transport activity
Nqo1 NM_017000 0,153161338 0,09509419 0,9313329 0,833712475 0,927082425 0,000223519
Cyb561 XM_221030 -0,028644328 -0,034319208 -0,617267222 0,977340962 0,978641469 0,003179802
Cxcl10 NM_139089 0,113398034 0,222659258 1,175083864 0,855674156 0,616446381 1,06E-06
Phgdh NM_031620 0,019449285 0,127790463 0,21275382 0,963270227 0,538281599 0,044674848
Akr1b4 NM_012498 0,211752133 0,205849841 0,441397541 0,661683708 0,680952818 0,037660927
  1. ▲: increased expression; : decreased expression; underscore means P value<0.05