Table 3 Oxidative stress related genes that show a significant change with microarray analysis after mutant huntingtin expression

Detoxification

Nqo1

NM_017000

0,153161338

0,09509419

0,9313329

0,833712475

0,927082425

0,000223519

▲

Gsta4

XM_217195

-0,275666227

-0,314801025

0,413131618

0,253015701

0,120614239

0,006374434

▲

Gstp2

NM_138974

0,382499361

0,418277366

1,459294326

0,30465786

0,189513652

2,28E-07

▲

Antioxidant/reducing Potential

Gclc

NM_012815

0,050889982

0,064489288

0,553224444

0,935159305

0,921933889

0,000668569

▲

Txnrd1

NM_031614

0,043006071

0,068186563

0,416963683

0,920763898

0,85987218

0,000404461

▲

Prdx6

NM_053576

-0,529339334

-0,578113241

-0,680873497

0,084587704

0,038158555

0,003140611

▼

Taldo1

NM_031811

0,009418008

0,032634451

-0,237774271

0,986167462

0,947870016

0,026954523

▼

Me1

NM_012600

-0,000528861

0,013155505

0,269261838

0,998825398

0,98787689

0,021535996

▲

Gene name

Accession#

Ratio day 0

Ratio day 1

Ratio day 5

P value day 0

P value day 1

P value day 5

TGF beta signalling pathway

Bambi

NM_139082

-0,039617538

-0,026338592

-0,864880442

0,977785277

0,990188964

0,00336128

▼

Smad4

NM_019275

-0,203348936

-0,40795009

-0,373068895

0,356782837

0,006017924

0,003289649

▼

Map3k1

NM_053887

-0,299368715

-0,358856734

-0,690663403

0,55056724

0,382654757

0,004166232

▼

Tgfb1

NM_021578

-0,126020083

-0,168731098

-0,366913617

0,684930689

0,490885028

0,004166232

▼

Madh7 (smad7)

NM_030858

-0,264074403

-0,230874139

-0,588447764

0,720614387

0,784042896

0,049193592

▼

Oxidative stress

Epas1

NM_023090

-0,270174359

-0,478814403

-1,093139357

0,688153639

0,259648489

0,000173015

▼

Frd1

XM_574642

0,131200174

0,166324378

0,387371459

0,560092481

0,355116774

0,000497262

▲

Mt3

NM_053968

0,415104171

0,340566391

1,552629091

0,456685437

0,588382185

4,64E-06

▲

Gpx1

NM_030826

0,118639332

0,007736138

0,307368335

0,5834878

0,991968688

0,002399689

▲

Electron transport activity

Nqo1

NM_017000

0,153161338

0,09509419

0,9313329

0,833712475

0,927082425

0,000223519

▲

Cyb561

XM_221030

-0,028644328

-0,034319208

-0,617267222

0,977340962

0,978641469

0,003179802

▼

Cxcl10

NM_139089

0,113398034

0,222659258

1,175083864

0,855674156

0,616446381

1,06E-06

▲

Phgdh

NM_031620

0,019449285

0,127790463

0,21275382

0,963270227

0,538281599

0,044674848

▲

Akr1b4

NM_012498

0,211752133

0,205849841

0,441397541

0,661683708

0,680952818

0,037660927

▲