Table 1 Bisulfite sequencing of the DBC1 locus
From: Optical mapping discerns genome wide DNA methylation profiles
F primer | GTA GGG TGT GTT TAT GT | |||
|---|---|---|---|---|
R primer | AAA AAA CTC TTA CTT CAT TCT | |||
dbc | CCTGAGTGTT | TCTGGGGCGG | CAGGTGTTTC | CACGGCCG [CG] |
7f | TTTGAGTGTT | TTTGGGGTGG | TAGGTGTTTT | TATGGTTGTG |
7r | TTTGAGTGTT | TTTGGGGTGG | TAGGTGTTTT | TATGGTTGTG |
18f | TTTGAGTGTT | TTTGGGGTGG | TAGGTGTTTT | TATGGTTGTG |
18r | TTTGAGTGTT | TTTGGGGTGG | TAGGTGTTTT | TATGGTTGTG |
4f | TTTGAGTGTT | TTTGGGGTGG | TAGGTGTTTT | TATGGTTGTG |
4r | TTTGAGTGTT | TTTGGGGTGG | TAGGTGTTTT | TATGGTTGTG |
12f | TTTGAGTGTT | TTTGGGGTGG | TAGGTGTTTT | TATGGTTGTG |
12r | TTTGAGTGTT | TTTGGGGTGG | TAGGTGTTTT | TATGGTTGTG |
3f | TTTGAGTGTT | TTTGGGGTGG | TAGGTGTTTT | TATGGTTGTG |
3r | TTTGAGTGTT | TTTGGGGTGG | TAGGTGTTTT | TATGGTTGTG |
2f | TTTGAGTGTT | TTTGGGGTGG | TAGGTGTTTT | TATGGTTGTG |
2r | TTTGAGTGTT | TTTGGGGTGG | TAGGTGTTTT | TATGGTTGTG |
16f | TTTGAGTGTT | TTTGGGGTGG | TAGGTGTTTT | TATGGTTGTG |
16r | TTTGAGTGTT | TTTGGGGTGG | TAGGTGTTTT | TATGGTTGTG |
13f | TTTGAGTGTT | TTTGGGGTGG | TAGGTGTTTT | TATGGTTGTG |
13r | TTTGAGTGTT | TTTGGGGTGG | TAGGTGTTTT | TATGGTTGTG |
6f | TTTGAGTGTT | TTTGGGGTGG | TAGGTGTTTT | TATGGTTGTG |
6r | TTTGAGTGTT | TTTGGGGTGG | TAGGTGTTTT | TATGGTTGTG |
8f | TTTGAGTGTT | TTTGGGGTGG | TAGGTGTTTT | TATGGTTGTG |
8r | TTTGAGTGTT | TTTGGGGTGG | TAGGTGTTTT | TATGGTTGTG |
10f | TTTGAGTGTT | TTTGGGGTGG | TAGGTGTTTT | TATGGTTGTG |
10r | TTTGAGTGTT | TTTGGGGTGG | TAGGTGTTTT | TATGGTTGTG |
| Â | ......... | ......... | ......... | ......... |
diff | TTTGAGTGTT | TTTGGGGTGG | TAGGTGTTTT | TATGGTTGTG |