Table 1 Significant patterns found with POCO from 1000 bp upstream sequences of C. elegans and C. briggsae

1

GAGA

11.61

15.38

34

ANAGNNNC

6.76

7.64

2

GANNNNGA

11.29

14.81

35

GGNNGA

6.63

8.29

3

GANANNG

10.95

13.06

36

GANGNG

6.62

8.61

4

ANAGNG

10.93

10.99

37

GNANNNGG

6.62

8.25

5

ANNNGNAG

9.74

11.04

38

GNANGNG

6.27

7.42

6

GANNNAG

9.70

11.64

39

GNAGNNNG

6.25

8.05

7

AGNGNNNA

9.50

9.56

40

GNNGNGNA

5.99

8.04

8

ANGNNGA

9.49

11.14

41

AGNGNNC

5.92

5.69

9

AGNGNA

9.40

9.60

42

GGNGG

5.91

7.64

10

GAGNG

9.36

9.48

43

GNNANNGG

5.91

6.96

11

AGNGA

9.35

11.93

44

ANNGGNNG

5.79

7.29

12

ANNGNNGA

9.01

10.00

45

GNGNNGG

5.73

7.65

13

GAANG

8.85

11.34

46

GNGNANG

5.73

6.83

14

AGNAG

8.75

11.58

47

ANGNGG

5.72

7.46

15

ANANGNG

8.65

10.35

48

ANNGGNG

5.59

6.84

16

GNNNANGA

8.53

11.19

49

ANNGNGG

5.56

6.56

17

AGNGNG

8.44

8.23

50

GGNNNANG

5.48

7.39

18

ANNNAGNG

8.33

10.28

51

ANNNGGC

5.45

5.79

19

GANGNNG

8.17

10.05

52

ANGNGNG

5.36

7.00

20

GNGNGNG

8.07

9.44

53

AGGNG

5.34

7.09

21

GNNGNNGA

7.91

9.69

54

GGNNNNGG

5.28

7.55

22

ANGAG

7.79

10.74

55

GNGNNANG

5.27

6.83

23

ANANGG

7.78

9.83

56

ANGGNG

5.26

6.61

24

AAGNG

7.75

10.14

57

AGNGG

5.21

6.80

25

GANNGNG

7.65

8.82

58

GGNNAG

5.07

6.65

26

GNNNGAG

7.59

9.32

59

GTNGNNNG

5.00

5.58

27

GNGAG

7.58

9.06

60

GGNNNNAG

4.92

6.89

28

AGNNNGNG

7.52

8.58

61

ANGGNNNG

4.89

6.69

29

GNNGAG

7.41

9.65

62

CGANNG

4.86

5.27

30

AGNANNG

7.41

9.22

63

ANGNNNCG

4.42

5.47

31

ANNGNGNG

7.17

8.95

64

GGNNNGG

4.38

7.20

32

GNNGNGA

6.92

8.44

65

ANNNGGNC

4.26

5.18

33

AGNNNAG

6.80

8.61