TY - JOUR AU - Chapman, R. W. PY - 2001 DA - 2001// TI - EcoGenomics - a consilience for comparative immunology? JO - Dev Comp Immunol VL - 25 ID - Chapman2001 ER - TY - BOOK AU - Van Straalen, N. M. AU - Roelofs, D. PY - 2006 DA - 2006// TI - An Introduction to Ecological Genomics PB - Oxford University Press CY - Oxford ID - Van Straalen2006 ER - TY - JOUR AU - Snell, T. W. AU - Brogdon, S. E. AU - Morgan, M. B. PY - 2003 DA - 2003// TI - Gene expression profiling in ecotoxicology JO - Ecotoxicology VL - 12 ID - Snell2003 ER - TY - JOUR AU - Brulle, F. AU - Morgan, A. J. AU - Cocquerelle, C. AU - Vandenbulcke, F. PY - 2010 DA - 2010// TI - Transcriptomic underpinning of toxicant-mediated physiological function alterations in three terrestrial invertebrate taxa: A review JO - Environ Pollut VL - 158 ID - Brulle2010 ER - TY - JOUR AU - Steinberg, C. E. W. AU - Sturzenbaum, S. R. AU - Menzel, R. PY - 2008 DA - 2008// TI - Genes and environment - striking the fine balance between sophisticated biomonitoring and true functional environmental genomics JO - Sci Total Environ VL - 400 ID - Steinberg2008 ER - TY - JOUR AU - Ankley, G. T. AU - Bennett, R. S. AU - Erickson, R. J. AU - Hoff, D. J. AU - Hornung, M. W. AU - Johnson, R. D. AU - Mount, D. R. AU - Nichols, J. W. AU - Russom, C. L. AU - Schmieder, P. K. PY - 2010 DA - 2010// TI - Adverse outcome pathways: a conceptual framework to support ecotoxicology research and risk assessment JO - Environ Toxicol and Chem VL - 29 ID - Ankley2010 ER - TY - JOUR AU - Martin, Y. C. AU - Kofron, J. L. AU - Traphagen, L. M. PY - 2002 DA - 2002// TI - Do structurally similar molecules have similar biological activity? JO - J Med Chem VL - 45 ID - Martin2002 ER - TY - JOUR AU - Patterson, D. E. AU - Cramer, R. D. AU - Ferguson, A. M. AU - Clark, R. D. AU - Weinberger, L. E. PY - 1996 DA - 1996// TI - Neighborhood behavior: a useful concept for validation of "molecular diversity" descriptors JO - J Med Chem VL - 39 ID - Patterson1996 ER - TY - JOUR AU - Vass, L. AU - Kelemen, J. Z. AU - Feher, L. Z. AU - Lorincz, Z. AU - Kulin, S. AU - Cseh, S. AU - Dorman, G. AU - Puskas, L. G. PY - 2009 DA - 2009// TI - Toxicogenomics screening of small molecules using high-density, nanocapillary real-time PCR JO - Int J Mol Med VL - 23 ID - Vass2009 ER - TY - JOUR AU - Spurgeon, S. L. AU - Jones, R. C. AU - Ramakrishnan, R. PY - 2008 DA - 2008// TI - High throughput gene expression measurement with real time PCR in a microfluidic Dynamic Array JO - PLoS ONE VL - 3 ID - Spurgeon2008 ER - TY - BOOK AU - Manahan, S. E. PY - 2003 DA - 2003// TI - Toxicological Chemistry and Biochemistry PB - CRC Press CY - Florida ID - Manahan2003 ER - TY - JOUR AU - Brennan, R. J. AU - Schiestl, R. H. PY - 1996 DA - 1996// TI - Cadmium is an inducer of oxidative stress in yeast JO - Mutat Res Fund Mol Mech Mut VL - 356 ID - Brennan1996 ER - TY - JOUR AU - Kültz, D. PY - 2005 DA - 2005// TI - Molecular and evolutionary basis of the cellular stress response JO - Annu Rev Physiol VL - 67 ID - Kültz2005 ER - TY - BOOK PY - 2004 DA - 2004// TI - A Textbook of Modern Toxicology ID - ref14 ER - TY - JOUR AU - Diatchenko, L. AU - Lau, Y. F. C. AU - Campbell, A. P. AU - Chenchik, A. AU - Moqadam, F. AU - Huang, B. AU - Lukyanov, S. AU - Lukyanov, K. AU - Gurskaya, N. AU - Sverdlov, E. D. AU - Siebert, P. D. PY - 1996 DA - 1996// TI - Suppression subtractive hybridization: a method for generating differentially regulated or tissue-specific cDNA probes and libraries JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 93 ID - Diatchenko1996 ER - TY - JOUR AU - Ozsolak, F. AU - Milos, P. M. PY - 2011 DA - 2011// TI - RNA sequencing: advances, challenges and opportunities JO - Nat Rev Genet VL - 12 ID - Ozsolak2011 ER - TY - JOUR AU - Nota, B. AU - Timmermans, M. AU - Franken, O. AU - Montagne-Wajer, K. AU - Marien, J. AU - De Boer, M. E. AU - De Boer, T. E. AU - Ylstra, B. AU - Van Straalen, N. M. AU - Roelofs, D. PY - 2008 DA - 2008// TI - Gene expression analysis of collembola in cadmium containing soil JO - Environ Sci Technol VL - 42 ID - Nota2008 ER - TY - JOUR AU - Gelfand, D. AU - Kastury, K. PY - 2009 DA - 2009// TI - High-throughput nanovolume qPCR JO - GEN VL - 29 ID - Gelfand2009 ER - TY - CHAP AU - Morrison, T. AU - Hurley, J. AU - Garcia, J. AU - Yoder, K. AU - Katz, A. AU - Roberts, D. AU - Cho, J. AU - Kanigan, T. AU - Ilyin, S. E. AU - Horowitz, D. PY - 2006 DA - 2006// TI - Nanoliter high throughput quantitative PCR BT - Nucleic Acids Res ID - Morrison2006 ER - TY - JOUR AU - Timmermans, M. J. T. N. AU - De Boer, M. E. AU - Nota, B. AU - De Boer, T. E. AU - Mariën, J. AU - Klein-Lankhorst, R. M. AU - van Straalen, N. M. AU - Roelofs, D. PY - 2007 DA - 2007// TI - Collembase: a repository for springtail genomics and soil quality assessment JO - BMC Genomics VL - 8 ID - Timmermans2007 ER - TY - CHAP AU - Littlefield, K. AU - Monroe, M. PY - 2010 DA - 2010// TI - Venn Diagram Plotter, v1.4.3740 BT - Year of release ID - Littlefield2010 ER - TY - JOUR AU - Adhikari, B. N. AU - Wall, D. H. AU - Adams, B. J. PY - 2009 DA - 2009// TI - Desiccation survival in an Antarctic nematode: molecular analysis using expressed sequenced tags JO - BMC Genomics VL - 10 ID - Adhikari2009 ER - TY - JOUR AU - Matejusova, I. AU - Felix, B. AU - Sorsa-Leslie, T. AU - Gilbey, J. AU - Noble, L. R. AU - Jones, C. S. AU - Cunningham, C. O. PY - 2006 DA - 2006// TI - Gene expression profiles of some immune relevant genes from skin of susceptible and responding Atlantic salmon (Salmo salar L.) infected with Gyrodactylus safaris (Monogenea) revealed by suppressive subtractive hybridisation JO - Int J Parasitol VL - 36 ID - Matejusova2006 ER - TY - JOUR AU - Griffitt, R. J. AU - Chandler, G. T. AU - Greig, T. W. AU - Quattro, J. M. PY - 2006 DA - 2006// TI - Cathepsin B and glutathione peroxidase show differing transcriptional responses in the grass shrimp, Palaemonetes pugio following exposure to three xenobiotics JO - Environ Sci Technol VL - 40 ID - Griffitt2006 ER - TY - JOUR AU - Hu, Z. L. AU - Bao, J. AU - Reecy, J. M. PY - 2008 DA - 2008// TI - CateGOrizer: A Web-Based Program to Batch Analyze Gene Ontology Classification Categories JO - Online J Bioinform VL - 9 ID - Hu2008 ER - TY - JOUR AU - Zheng, Q. AU - Wang, X. J. PY - 2008 DA - 2008// TI - GOEAST: a web-based software toolkit for Gene Ontology enrichment analysis JO - Nucleic Acids Res VL - 36 ID - Zheng2008 ER - TY - BOOK AU - Brereton, R. G. PY - 2007 DA - 2007// TI - Applied Chemometrics for Scientists PB - Wiley CY - Chichester ID - Brereton2007 ER - TY - JOUR AU - Carbon, S. AU - Ireland, A. AU - Mungall, C. J. AU - Shu, S. AU - Marshall, B. AU - Lewis, S. PY - 2009 DA - 2009// TI - AmiGO: online access to ontology and annotation data JO - Bioinformatics VL - 25 ID - Carbon2009 ER - TY - JOUR AU - Bochtler, M. AU - Ditzel, L. AU - Groll, M. AU - Hartmann, C. AU - Huber, R. PY - 1999 DA - 1999// TI - The proteasome JO - Annu Rev Biophys Biomol Struct VL - 28 ID - Bochtler1999 ER - TY - JOUR AU - Aharonowitz, Y. AU - Cohen, G. AU - Martin, J. F. PY - 1992 DA - 1992// TI - Penicillin and cephalosporin biosynthetic genes - structure, organization, regulation and evolution JO - Annu Rev Microbiol VL - 46 ID - Aharonowitz1992 ER - TY - JOUR AU - Nota, B. AU - Bosse, M. AU - Ylstra, B. AU - van Straalen, N. M. AU - Roelofs, D. PY - 2009 DA - 2009// TI - Transcriptomics reveals extensive inducible biotransformation in the soil-dwelling invertebrate Folsomia candida exposed to phenanthrene JO - BMC Genomics VL - 10 ID - Nota2009 ER - TY - JOUR AU - Wold, S. AU - Sjostrom, M. AU - Eriksson, L. PY - 2001 DA - 2001// TI - PLS-regression: a basic tool of chemometrics JO - Chemom Intell Lab Syst VL - 58 ID - Wold2001 ER - TY - JOUR AU - Martens, H. AU - Martens, M. PY - 2000 DA - 2000// TI - Modified Jack-knife estimation of parameter uncertainty in bilinear modelling by partial least squares regression (PLSR) JO - Food Qual Preference VL - 11 ID - Martens2000 ER - TY - JOUR AU - Valko, M. AU - Morris, H. AU - Cronin, M. T. D. PY - 2005 DA - 2005// TI - Metals, toxicity and oxidative stress JO - Curr Med Chem VL - 12 ID - Valko2005 ER - TY - JOUR AU - Stroomberg, G. J. AU - Zappey, H. AU - Steen, R. AU - van Gestel, C. A. M. AU - Ariese, F. AU - Velthorst, N. H. AU - Van Straalen, N. M. PY - 2004 DA - 2004// TI - PAH biotransformation in terrestrial invertebrates - a new phase II metabolite in isopods and springtails JO - Comp Biochem Physiol C: Toxicol Pharmacol VL - 138 ID - Stroomberg2004 ER - TY - JOUR AU - Lauer, C. M. AU - Bonatto, D. AU - Mielniczki-Pereira, A. A. AU - Schuch, A. Z. AU - Dias, J. F. AU - Yoneama, M. L. AU - Henriques, J. A. P. PY - 2008 DA - 2008// TI - The PMR1 protein, the major yeast Ca2+-ATPase in the Golgi, regulates intracellular levels of the cadmium ion JO - Fems Microbiol Lett VL - 285 ID - Lauer2008 ER - TY - JOUR AU - Schoeber, J. P. H. AU - Topala, C. N. AU - Lee, K. P. AU - Lambers, T. T. AU - Ricard, G. AU - Van der Kemp, A. AU - Huynen, M. A. AU - Hoenderop, J. G. J. AU - Bindels, R. J. M. PY - 2008 DA - 2008// TI - Identification of NIPSNAP1 as a novel auxiliary protein inhibiting TRPV6 activity JO - Pflugers Arch VL - 457 ID - Schoeber2008 ER - TY - JOUR AU - Roelofs, D. AU - Marien, J. AU - van Straalen, N. M. PY - 2007 DA - 2007// TI - Differential gene expression profiles associated with heavy metal tolerance in the soil insect Orchesella cincta JO - Insect Biochem Mol Biol VL - 37 ID - Roelofs2007 ER - TY - JOUR AU - Jamieson, D. J. PY - 1998 DA - 1998// TI - Oxidative stress responses of the yeast Saccharomyces cerevisiae JO - Yeast VL - 14 ID - Jamieson1998 ER - TY - JOUR AU - Timmermans, M. AU - Ellers, J. AU - Roelofs, D. AU - Van Straalen, N. M. PY - 2005 DA - 2005// TI - Metallothionein mRNA expression and cadmium tolerance in metal-stressed and reference populations of the springtail Orchesella cincta JO - Ecotoxicology VL - 14 ID - Timmermans2005 ER - TY - JOUR AU - Sterenborg, I. AU - Roelofs, D. PY - 2003 DA - 2003// TI - Field-selected cadmium tolerance in the springtail Orchesella cincta is correlated with increased metallothionein mRNA expression JO - Insect Biochem Mol Biol VL - 33 ID - Sterenborg2003 ER - TY - JOUR AU - Haq, F. AU - Mahoney, M. AU - Koropatnick, J. PY - 2003 DA - 2003// TI - Signaling events for metallothionein induction JO - Mutat Res VL - 533 ID - Haq2003 ER - TY - JOUR AU - Nakamori, T. AU - Fujimori, A. AU - Kinoshita, K. AU - Ban-nai, T. AU - Kubota, Y. AU - Yoshida, S. PY - 2010 DA - 2010// TI - mRNA expression of a cadmium-responsive gene is a sensitive biomarker of cadmium exposure in the soil collembolan Folsomia candida JO - Environ Pollut VL - 158S ID - Nakamori2010 ER - TY - JOUR AU - Cannino, G. AU - Ferruggia, E. AU - Luparello, C. AU - Rinaldi, A. M. PY - 2009 DA - 2009// TI - Cadmium and mitochondria JO - Mitochondrion VL - 9 ID - Cannino2009 ER - TY - JOUR AU - Davies, K. J. A. PY - 2001 DA - 2001// TI - Degradation of oxidized proteins by the 20S proteasome JO - Biochimie VL - 83 ID - Davies2001 ER - TY - JOUR AU - Hochstrasser, M. PY - 1995 DA - 1995// TI - Ubiquitin, proteasomes, and the regulation of intracellular protein degradation JO - Curr Opin Cell Biol VL - 7 ID - Hochstrasser1995 ER - TY - JOUR AU - Roelofs, D. AU - Janssens, T. K. S. AU - Timmermans, M. AU - Nota, B. AU - Marien, J. AU - Bochdanovits, Z. AU - Ylstra, B. AU - Van Straalen, N. M. PY - 2009 DA - 2009// TI - Adaptive differences in gene expression associated with heavy metal tolerance in the soil arthropod Orchesella cincta JO - Mol Ecol VL - 18 ID - Roelofs2009 ER - TY - JOUR AU - Valbonesi, P. AU - Ricci, L. AU - Franzellitti, S. AU - Biondi, C. AU - Fabbri, E. PY - 2008 DA - 2008// TI - Effects of cadmium on MAPK signalling pathways and HSP70 expression in a human trophoblast cell line JO - Placenta VL - 29 ID - Valbonesi2008 ER - TY - JOUR AU - Kamata, H. AU - Tanaka, C. AU - Yagisawa, H. AU - Matsuda, S. AU - Gotoh, Y. AU - Nishida, E. AU - Hirata, H. PY - 1996 DA - 1996// TI - Suppression of nerve growth factor-induced neuronal differentiation of PC12 cells - N-acetylcysteine uncouples the signal transduction from Ras to the mitogen-activated protein kinase cascade JO - J Biol Chem VL - 271 ID - Kamata1996 ER - TY - JOUR AU - Gottlieb, R. A. PY - 2000 DA - 2000// TI - Programmed cell death JO - Drug News Perspect VL - 13 ID - Gottlieb2000 ER - TY - JOUR AU - Cui, Y. X. AU - Freedman, J. H. PY - 2009 DA - 2009// TI - Cadmium induces retinoic acid signaling by regulating retinoic acid metabolic gene expression JO - J Biol Chem VL - 284 ID - Cui2009 ER - TY - JOUR AU - Escher, B. I. AU - Hermens, J. L. M. PY - 2002 DA - 2002// TI - Modes of action in ecotoxicology: their role in body burdens, species sensitivity, QSARs, and mixture effects JO - Environ Sci Technol VL - 36 ID - Escher2002 ER - TY - JOUR AU - Lee, S. H. AU - Kang, J. S. AU - Min, J. S. AU - Yoon, K. S. AU - Strycharz, J. P. AU - Johnson, R. AU - Mittapalli, V. M. AU - Margam, V. M. AU - Sun, W. AU - Li, H. M. PY - 2010 DA - 2010// TI - Decreased detoxification genes and genome size make the human body louse an efficient model to study xenobiotic metabolism JO - Insect Mol Biol VL - 19 ID - Lee2010 ER - TY - JOUR AU - Søfteland, L. AU - Eide, I. AU - Olsvik, P. A. PY - 2009 DA - 2009// TI - Factorial design applied for multiple endpoint toxicity evaluation in Atlantic salmon (Salmo salar L.) hepatocytes JO - Toxicol in Vitro VL - 23 ID - Søfteland2009 ER - TY - JOUR AU - Wang, R. AU - Morris, D. S. AU - Tomlins, S. A. AU - Lonigro, R. J. AU - Tsodikov, A. AU - Mehra, R. AU - Giordano, T. J. AU - Kunju, L. P. AU - Lee, C. T. AU - Weizer, A. Z. AU - Chinnaiyan, A. M. PY - 2009 DA - 2009// TI - Development of a multiplex quantitative PCR signature to predict progression in non-muscle-invasive bladder cancer JO - Cancer Res VL - 69 ID - Wang2009 ER - TY - JOUR AU - Ståhlberg, A. AU - Elbing, K. AU - Andrade-Garda, J. M. AU - Sjogreen, B. AU - Forootan, A. AU - Kubista, M. PY - 2008 DA - 2008// TI - Multiway real-time PCR gene expression profiling in yeast Saccharomyces cerevisiae reveals altered transcriptional response of ADH-genes to glucose stimuli JO - BMC Genomics VL - 9 ID - Ståhlberg2008 ER - TY - JOUR AU - Andersen, M. E. AU - Dennison, J. E. AU - Thomas, R. S. AU - Conolly, R. B. PY - 2005 DA - 2005// TI - New directions in incidence-dose modeling JO - Trends Biotechnol VL - 23 ID - Andersen2005 ER - TY - JOUR AU - Van Gestel, C. A. M. AU - Koolhaas, J. E. PY - 2004 DA - 2004// TI - Water-extractability, free ion activity, and pH explain cadmium sorption and toxicity to Folsomia candida (Collembola) in seven soil-pH combinations JO - Environ Toxicol Chem VL - 23 ID - Van Gestel2004 ER - TY - JOUR AU - De Boer, M. E. AU - De Boer, T. E. AU - Marien, J. AU - Timmermans, M. AU - Nota, B. AU - van Straalen, N. M. AU - Ellers, J. AU - Roelofs, D. PY - 2009 DA - 2009// TI - Reference genes for QRT-PCR tested under various stress conditions in Folsomia candida and Orchesella cincta (Insecta, Collembola) JO - BMC Mol Biol VL - 10 ID - De Boer2009 ER - TY - JOUR AU - Droge, S. T. J. AU - Paumen, M. L. AU - Bleeker, E. A. J. AU - Kraak, M. H. S. AU - van Gestelt, C. A. M. PY - 2006 DA - 2006// TI - Chronic toxicity of polycyclic aromatic compounds to the springtail Folsomia candida and the enchytraeid Enchytraeus crypticus JO - Environ Toxicol Chem VL - 25 ID - Droge2006 ER - TY - JOUR AU - Van Gestel, C. A. M. AU - Van Diepen, A. M. F. PY - 1997 DA - 1997// TI - The influence of soil moisture content on the bioavailability and toxicity of cadmium for Folsomia candida Willem (Collembola: Isotomidae) JO - Ecotoxicol Environ Saf VL - 36 ID - Van Gestel1997 ER - TY - JOUR AU - Van Gestel, C. A. M. AU - Mol, S. PY - 2003 DA - 2003// TI - The influence of soil characteristics on cadmium toxicity for Folsomia candida (Collembola: isotomidae) JO - Pedobiologia VL - 47 ID - Van Gestel2003 ER - TY - STD TI - GO Slim and Subset Guide., http://www.geneontology.org/GO.slims.shtml UR - http://www.geneontology.org/GO.slims.shtml ID - ref63 ER - TY - CHAP PY - 2008 DA - 2008// TI - GenEx Light Software BT - MultiD Analyses AB ID - ref64 ER - TY - CHAP PY - 2009 DA - 2009// TI - The Unscrambler Software BT - CAMO ASA ID - ref65 ER - TY - STD TI - CAMO ASA : The Unscrambler User Manual. http://www.camo.com UR - http://www.camo.com ID - ref66 ER - TY - STD TI - Chart Tool. http://www.onlinecharttool.com UR - http://www.onlinecharttool.com ID - ref67 ER -