Table 4 Candidate reference genes and best combination of two genes (BCTG) listed according to their expression stability calculated by NormFinder in five data sets.
From: Identification and validation of reference genes for quantitative RT-PCR normalization in wheat
| Â | I Data set | Â | II Data set | Â | III Data set | Â | IV Data set | Â | V Data set | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Â | UniGene Cluster | Stabil. value | Â | UniGene Cluster | Stabil. value | Â | UniGene Cluster | Stabil. value | Â | UniGene Cluster | Stabil. value | Â | UniGene Cluster | Stabil. value |
1) | Ta54227 | 0.035 | 1) | Ta54227 | 0.032 | 1) | Ta30797 | 0.030 | 1) | Ta30797 | 0.061 | 1) | Ta54227 | 0.022 |
2) | Ta2291 | 0.049 | 2) | Ta2291 | 0.064 | 2) | Ta4045 | 0.033 | 2) | Ta54227 | 0.065 | 2) | Ta53889 | 0.038 |
3) | Ta2776 | 0.055 | 3) | Ta54948 | 0.064 | 3) | Ta54948 | 0.038 | 3) | Ta1698 | 0.069 | 3) | Ta50503 | 0.051 |
4) | Ta35284 | 0.057 | 4) | Ta2776 | 0.072 | 4) | Ta54238 | 0.046 | 4) | Ta2776 | 0.072 | 4) | Ta4045 | 0.054 |
5) | Ta53919 | 0.063 | 5) | Ta54448 | 0.073 | 5) | Ta2291 | 0.048 | 5) | Ta53967 | 0.081 | 5) | Ta54238 | 0.072 |
6) | Ta53967 | 0.064 | 6) | Ta35284 | 0.074 | 6) | Ta1698 | 0.052 | 6) | Ta54963 | 0.082 | 6) | Ta55512 | 0.088 |
7) | Ta54171 | 0.066 | 7) | Ta53919 | 0.077 | 7) | Ta54733 | 0.054 | 7) | Ta54948 | 0.082 | 7) | Ta53967 | 0.091 |
8) | Ta54963 | 0.067 | 8) | Ta54171 | 0.080 | 8) | Ta22845 | 0.054 | 8) | Ta54448 | 0.084 | 8) | Ta54448 | 0.091 |
9) | Ta54733 | 0.068 | 9) | Ta53967 | 0.080 | 9) | Ta2776 | 0.063 | 9) | Ta22845 | 0.098 | 9) | Ta53919 | 0.095 |
10) | Ta4045 | 0.069 | 10) | Ta35497 | 0.081 | 10) | Ta35284 | 0.068 | 10) | Ta44405 | 0.099 | 10) | Ta53937 | 0.096 |
11) | Ta54448 | 0.069 | 11) | Ta54733 | 0.082 | 11) | Ta53937 | 0.073 | 11) | Ta53891 | 0.102 | 11) | Ta35284 | 0.098 |
12) | Ta22845 | 0.073 | 12) | Ta54963 | 0.084 | 12) | Ta54963 | 0.074 | 12) | Ta54238 | 0.103 | 12) | Ta2776 | 0.101 |
13) | Ta53937 | 0.074 | 13) | Ta4045 | 0.090 | 13) | Ta54512 | 0.080 | 13) | Ta54280 | 0.106 | 13) | Ta2291 | 0.102 |
14) | Ta53889 | 0.075 | 14) | Ta53899 | 0.093 | 14) | Ta54171 | 0.084 | 14) | Ta35284 | 0.108 | 14) | Ta54447 | 0.106 |
15) | Ta54238 | 0.077 | 15) | Ta54280 | 0.093 | 15) | Ta53967 | 0.086 | 15) | Ta54171 | 0.114 | 15) | Ta53891 | 0.107 |
16) | Ta54280 | 0.080 | 16) | Ta22845 | 0.096 | 16) | Ta54825 | 0.088 | 16) | Ta53937 | 0.124 | 16) | Ta53964 | 0.107 |
17) | Ta50503 | 0.084 | 17) | Ta54238 | 0.097 | 17) | Ta53889 | 0.093 | 17) | Ta25534 | 0.137 | 17) | Ta53948 | 0.107 |
18) | Ta53964 | 0.089 | 18) | Ta53937 | 0.097 | 18) | Ta54447 | 0.099 | 18) | Ta53919 | 0.145 | 18) | Ta35497 | 0.109 |
19) | Ta54512 | 0.092 | 19) | Ta53964 | 0.103 | 19) | Ta53919 | 0.103 | 19) | Ta2291 | 0.148 | 19) | Ta22845 | 0.113 |
20) | Ta55512 | 0.095 | 20) | Ta50503 | 0.106 | 20) | Ta54227 | 0.105 | 20) | Ta54733 | 0.155 | 20) | Ta38797 | 0.114 |
21) | Ta25534 | 0.100 | 21) | Ta54512 | 0.113 | 21) | Ta50503 | 0.123 | 21) | Ta35497 | 0.158 | 21) | Ta30768 | 0.119 |
22) | Ta1698 | 0.101 | 22) | Ta25534 | 0.117 | 22) | Ta55512 | 0.144 | 22) | Ta50503 | 0.167 | 22) | Ta25534 | 0.121 |
23) | Ta30797 | 0.104 | 23) | Ta55512 | 0.119 | 23) | Ta30768 | 0.168 | 23) | Ta53964 | 0.181 | 23) | Ta54512 | 0.136 |
24) | Ta54948 | 0.105 | 24) | Ta30797 | 0.129 | 24) | Ta54280 | 0.173 | 24) | Ta38797 | 0.182 | 24) | Ta54733 | 0.152 |
25) | Ta30768 | 0.110 | 25) | Ta30768 | 0.132 | 25) | Ta35497 | 0.177 | 25) | Ta30768 | 0.187 | 25) | Ta27771 | 0.157 |
26) | Ta54447 | 0.113 | 26) | Ta1698 | 0.134 | 26) | Ta54448 | 0.181 | 26) | Ta54825 | 0.219 | 26) | Ta30797 | 0.170 |
27) | Ta35497 | 0.116 | 27) | Ta38797 | 0.138 | 27) | Ta53964 | 0.184 | 27) | Ta55512 | 0.223 | 27) | Ta54171 | 0.172 |
28) | Ta27771 | 0.118 | 28) | Ta53891 | 0.141 | 28) | Ta27771 | 0.195 | 28) | Ta53889 | 0.247 | 28) | Ta54963 | 0.173 |
29) | Ta54825 | 0.135 | 29) | Ta54447 | 0.142 | 29) | Ta25534 | 0.201 | 29) | Ta27771 | 0.250 | 29) | Ta54280 | 0.197 |
30) | Ta53891 | 0.135 | 30) | Ta54825 | 0.144 | 30) | Ta38797 | 0.207 | 30) | Ta54447 | 0.254 | 30) | Ta54825 | 0.208 |
31) | Ta44405 | 0.150 | 31) | Ta27771 | 0.146 | 31) | Ta44405 | 0.304 | 31) | Ta4045 | 0.255 | 31) | Ta44405 | 0.303 |
32) | Ta38797 | 0.198 | 32) | Ta44405 | 0.171 | 32) | Ta53891 | 0.352 | 32) | Ta54512 | 0.295 | 32) | Ta1698 | 0.322 |
| Â | BCTG | Â | Â | BCTG | Â | Â | BCTG | Â | Â | BCTG | Â | Â | BCTG | Â |
| Â | Ta54227+Ta2291 | 0.030 | Â | Ta54227+Ta2291 | 0.032 | Â | Ta30797+Ta4045 | 0.023 | Â | Ta30797+Ta54227 | 0.045 | Â | Ta54227+Ta53889 | 0.022 |